RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA1P01009 418 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GAD2Q05329 585 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ALG2Q9H553 416 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MTRRQ9UBK8 725 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 BCKDKO14874 412 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AHCYL1O43865 530 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ACAP2Q15057 778 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 KCT2Q8NC54 265 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FAM110BQ8TC76 370 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SDCBP2Q9H190 292 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEH1Q9H213 219 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NOL4O94818 638 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 POU2F1P14859 743 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MNDAP41218 407 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AMZ1Q400G9 498 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NCK1P16333 377 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CD247P20963 164 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TGFBR2P37173 567 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 OR2T3Q8NH03 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SMPDL3BQ92485 455 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AGAP2Q99490 1192 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IL12RB2Q99665 862 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 HCN1O60741 890 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LYNP07948 512 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 COL6A2P12110 1019 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CSKP41240 450 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 LIPEQ05469 1076 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FUT2Q10981 343 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NAPRTQ6XQN6 538 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C12orf66Q96MD2 445 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GNB5O14775 395 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NDST2P52849 883 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G16P53816 162 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DCST1Q5T197 706 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CDH22Q9UJ99 828 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MC1RQ01726 317 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCD3Q6STE5 483 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SNX33Q8WV41 574 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SPOCK2Q92563 424 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 OR2AG1Q9H205 316 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ATRNO75882 1429 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 DNASE1L1P49184 302 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 TEAD4Q15561 434 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 GFOD2Q3B7J2 385 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 S100A14Q9HCY8 104 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 IRGMA1A4Y4 181 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ABATP80404 500 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ENPEPQ07075 957 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MYBPC3Q14896 1274 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 CLCC1Q96S66 551 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 SETD6Q8TBK2 473 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 MBD2Q9UBB5 411 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PTPRM-201ENST00000332175 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.11■■□□□ 1.13
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