RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 NIPSNAP2O75323 286 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 GGT5P36269 586 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 PPP2R2BQ00005 443 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 PTPRRQ15256 657 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 CNIH3Q8TBE1 160 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 B3GALT6Q96L58 329 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 POPDC3Q9HBV1 291 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 AKIP1Q9NQ31 210 aa24.96■■□□□ 1.59
SENP3-201ENST00000321337 FAM92AA1XBS5 289 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TULP3O75386 442 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 CHEK2O96017 543 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 RAD51Q06609 339 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TLK2Q86UE8 772 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 SLCO6A1Q86UG4 719 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 DPP10Q8N608 796 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 OR10A6Q8NH74 314 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 MTRRQ9UBK8 725 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 U3KQV3 271 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 E2F3O00716 465 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN12O95859 305 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 BEND5Q7L4P6 421 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 SLC1A7O00341 560 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 HMBSP08397 361 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 RHOQP17081 205 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ISL1P61371 349 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PTPRNQ16849 979 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TYSND1Q2T9J0 566 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 FBXL22Q6P050 247 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 CYP20A1Q6UW02 462 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 POLE4Q9NR33 117 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 AQP9O43315 295 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 HS6ST1O60243 411 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 UGT2B11O75310 529 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TRIM32Q13049 653 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ZNF846Q147U1 533 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PGS1Q32NB8 556 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TTC23Q5W5X9 447 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TMEM53Q6P2H8 277 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 GPR152Q8TDT2 470 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 COMMD8Q9NX08 183 aa24.94■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D4O60343 1298 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 KATNA1O75449 491 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 CAPN1P07384 714 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 CNPP09543 421 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 MAP2K4P45985 399 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 TMEM236Q5W0B7 351 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 SLC39A13Q96H72 371 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 MAGED4Q96JG8 741 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ADGRE2Q9UHX3 823 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD28O15084 1053 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 GPR39O43194 453 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 MITFO75030 526 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 UGT2B4P06133 528 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PFKLP17858 780 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PIANPQ8IYJ0 282 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ZNF555Q8NEP9 628 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 OR56A4Q8NGH8 313 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 NODALQ96S42 347 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 CD274Q9NZQ7 290 aa24.93■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 NDUFS2O75306 463 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 SOAT2O75908 522 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PRKD3O94806 890 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 OGNP20774 298 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 EFEMP1Q12805 493 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 PTGR1Q14914 329 aa24.92■■□□□ 1.58
SENP3-201ENST00000321337 LAPTM4AQ15012 233 aa24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms