RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF10CO14798 259 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 LILRB5O75023 590 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMZ2Q86W34 360 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF547Q8IVP9 402 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC63Q8NA47 563 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 DERL2Q9GZP9 239 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS38A1L453 326 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL33A6NCF5 533 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT4DA6NG13 374 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 VCLP18206 1134 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD38P28907 300 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNR2P34972 360 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1A2P50993 1020 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V0D1P61421 351 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC153Q494R4 210 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP68Q76N32 757 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO1HQ8N1T3 1032 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFSD2AQ8NA29 543 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGARPQ8TDB4 240 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM111AQ96PZ2 611 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4F12Q9HCS2 524 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF22Q9HCT0 170 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGSF5Q9NSI5 407 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF358Q9NW07 568 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUFUQ9UMX1 484 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPSM3Q9Y4H4 160 aa26.95■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNPDA1P46926 289 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLRBP48167 497 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OVGP1Q12889 678 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLG1Q12959 904 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACAP2Q15057 778 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 HHATQ5VTY9 493 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf46Q6P387 395 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP206Q8IYR0 622 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2L2Q8NH16 312 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 HM13Q8TCT9 377 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNASE2BQ8WZ79 361 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSCAN32Q9NX65 697 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC28Q96AY4 2481 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBP1P09455 135 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP8P85298 464 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYSMD4Q5XG99 296 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 RD3Q7Z3Z2 195 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCHQ86VS3 1027 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPNS2Q8IVW8 549 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDM1Q8TC05 714 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKA1Q96BD8 255 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM9SF3Q9HD45 589 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM216Q9P0N5 145 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC17A7Q9P2U7 560 aa26.94■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD1DP15813 335 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFEBP19484 476 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRP54P61011 504 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 IRX4P78413 519 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MPP2Q14168 576 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPT1Q15389 498 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PYCR3Q53H96 274 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1E3Q8WZA6 343 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MID2Q9UJV3 735 aa26.93■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 KCNJ13O60928 360 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SP9P0CG40 484 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHN1P15882 459 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMS2CLQ68D20 193 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf96Q7Z7L8 435 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC2Q8NEN0 867 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2M4Q96R27 311 aa26.92■■□□□ 1.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms