RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 SHISA7A6NL88 538 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 SNX3O60493 162 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 KLHL2O95198 593 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ENPP1P22413 925 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 TNFRSF4P43489 277 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 CGB2Q6NT52 195 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ERAP2Q6P179 960 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 GALNT7Q86SF2 657 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 FITM2Q8N6M3 262 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 SCAIQ8N9R8 606 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 FAM13CQ8NE31 585 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 CGREF1Q99674 301 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 XPR1Q9UBH6 696 aa16.08■□□□□ 0.17
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PP55 124 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 G3V2L1 256 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM16O95361 564 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CPA3P15088 417 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ACRV1P26436 265 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 DRD3P35462 400 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 DPPA4Q7L190 304 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 COPG2Q9UBF2 871 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 H3BMM5 538 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 K7ESM1 405 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FBP2O00757 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 INPP4BO15327 924 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB14O43829 449 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 B4GALNT1Q00973 533 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 INSCQ1MX18 579 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 NXPE1Q8N323 547 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FLCNQ8NFG4 579 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 EXT2Q93063 718 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 P2RY12Q9H244 342 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ALG9Q9H6U8 611 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TBCCD1Q9NVR7 557 aa16.08■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 NTSR1P30989 418 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PTGER3P43115 390 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CCR10P46092 362 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 BST1Q10588 318 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ITGA9Q13797 1035 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CST6Q15828 149 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 NRG4Q8WWG1 115 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 GAB3Q8WWW8 586 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 KLK6Q92876 244 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CD93Q9NPY3 652 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 E5RI56 91 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ITM2AO43736 263 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 OR6B1O95007 311 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 RELAQ04206 551 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ENPP2Q13822 863 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC6Q16204 474 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FNDC8Q8TC99 324 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 GANCQ8TET4 914 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 PTERQ96BW5 349 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CLPBQ9H078 707 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.07■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 AREL1O15033 823 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF30P17039 623 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 ARRB2P32121 409 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.06■□□□□ 0.16
CHTF18-202ENST00000317063 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms