RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MEMO1Q9Y316 297 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HES2Q9Y543 173 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PSMD11O00231 422 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SH3BGRLO75368 114 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF1O95521 474 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCNE2O96020 404 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 BRCC3P46736 316 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IFI44LQ53G44 452 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 DNASE1L2Q92874 299 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ART5Q96L15 291 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C12orf42Q96LP6 360 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NPAS2Q99743 824 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.14□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FAM234BA2RU67 622 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TNFRSF21O75509 655 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PGRP06401 933 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NT5EP21589 574 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CCL23P55773 120 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RAB15P59190 212 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SP140Q13342 867 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GPR33Q49SQ1 333 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 USP43Q70EL4 1123 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CPT1BQ92523 772 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TOP1MTQ969P6 601 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 IPPKQ9H8X2 491 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RHPN2P1A8MT19 583 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 KMOO15229 486 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LRATO95237 230 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PIGRP01833 764 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C9P02748 559 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LAMP2P13473 410 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SNAPC1Q16533 368 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ECM1Q16610 540 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NEK7Q8TDX7 302 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 HMCESQ96FZ2 354 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C8orf48Q96LL4 319 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GPR21Q99679 349 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ALG2Q9H553 416 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GNB5O14775 395 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EPHB6O15197 1021 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RENP00797 406 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ALPPP05187 535 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TFPIP10646 304 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ITPKAP23677 461 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ABCG1P45844 678 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 RPIAP49247 311 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CYP1B1Q16678 543 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GPR107Q5VW38 600 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LBX2Q6XYB7 198 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC34A3Q8N130 599 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 LIX1Q8N485 282 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MEIOBQ8N635 442 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C12orf29Q8N999 325 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 ZNF527Q8NB42 609 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CPXM1Q96SM3 734 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 MIPEPQ99797 713 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 TCF25Q9BQ70 676 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 CNTN3Q9P232 1028 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.13□□□□□ -1.27
CPS1-201ENST00000233072 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.13□□□□□ -1.27
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