RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifrd2Q9D8U0 441 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smg9Q9DB90 520 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ddx59Q9DBN9 619 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ascl3Q9JJR7 174 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pias4Q9JM05 507 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Carm1Q9WVG6 608 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sema4fQ9Z123 777 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gipc2Q9Z2H7 314 aa9.14□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13283A0A087WPG5 182 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acnat1A2AKK5 416 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11563B1AQ90 168 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam151bD3YUE4 279 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp169E9Q3R6 731 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab11fip2G3XA57 512 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10715J3QP74 227 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox2gL7MUB9 191 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r8L7N472 848 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dgcr6O35347 198 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wisp1O54775 367 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxb3P09026 433 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ca8P28651 291 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Etv2P41163 335 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccr7P47774 378 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plk2P53351 682 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stx1bP61264 288 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rps17P63276 135 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ldb1P70662 411 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem207P86045 143 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CtscP97821 462 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RalgdsQ03385 852 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Naf1Q3UMQ8 489 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp30Q3UN04 517 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11992Q5SS90 291 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gata6Q61169 589 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Itga7Q61738 1179 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ablim3Q69ZX8 682 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atg16l2Q6KAU8 623 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pnma8aQ80VM8 430 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb24Q80X44 710 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Coq4Q8BGB8 266 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SybuQ8BHS8 665 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lrfn3Q8BLY3 626 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Man2a2Q8BRK9 1152 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Peli3Q8BXR6 445 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nmur2Q8BZ39 395 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fmo9Q8C116 539 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb44Q8R0A2 453 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc30a5Q8R4H9 761 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1311Q8VET0 312 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr273Q8VG87 317 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nme5Q99MH5 211 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LipfQ9CPP7 395 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cmc1Q9CPZ8 106 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Unc50Q9CQ61 259 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx2Q9CWK8 519 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slco6d1Q9D5W6 683 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krtap4-7Q9D732 168 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glod5Q9D8I3 148 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a17Q9D9E0 401 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PyglQ9ET01 850 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc29a1Q9JIM1 460 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nectin1Q9JKF6 515 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acsl4Q9QUJ7 711 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Keap1Q9Z2X8 624 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kat6aQ8BZ21 2003 aa9.13□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A0A1Y7VP24 259 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grin3aA2AIR5 1135 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mllt3A2AM29 569 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssxb6A2BI74 170 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Catsperg2C6KI89 1145 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gprin2D3Z1D7 455 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp788E9Q980 884 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AF366264G3X9P9 502 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6351K9J7D1 481 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ebf2O08792 575 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nedd9O35177 833 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nrg3O35181 713 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Azin1O35484 448 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2b19O55071 492 aa9.12□□□□□ -0.95
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.2 ms