RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pole4Q9CQ36 118 aa12.52□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa12.52□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il23aQ9EQ14 196 aa12.52□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fhl5Q9WTX7 284 aa12.52□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14781A2A9Q9 366 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam3E9Q6J4 706 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd4P06332 457 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd3P14685 530 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mageb5Q14AN0 366 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naf1Q3UMQ8 489 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slfn4Q3UV66 602 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfap2cQ61312 449 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints6Q6PCM2 883 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx32Q80ZJ7 404 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6377Q8BHV4 303 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfm2Q8BM13 448 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8CC96 669 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd2dQ91VV4 469 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nck1Q99M51 377 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc18Q9CQ07 262 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sugt1Q9CX34 336 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrelpQ9JK53 378 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrebQ9WUQ2 417 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ralgps1A2AR50 585 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13285B1AYI3 182 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13275B1AYI8 182 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl4B1AZR0 717 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r76F8VQ63 324 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scamp3O35609 349 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox6O70238 227 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt4P07744 525 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PolP11369 1281 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp3cbP48453 525 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa4lP48722 838 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam47cQ14BE7 430 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PomkQ3TUA9 349 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LchnQ3UHG7 455 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga7Q61738 1179 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 InavaQ7TN12 663 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc116Q80X53 541 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3galnt2Q8BG28 504 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IfnzQ8BQT1 182 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc32Q8BS39 179 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13278Q8CD73 182 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kremen2Q8K1S7 461 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Treml1Q8K558 317 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard13Q923Q2 1113 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnot11Q9CWN7 505 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl20Q9CZV8 436 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D1F3 157 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrirQ9D735 173 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs1Q9JL25 209 aa12.51□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7971J3QMM8 481 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PbsnO08976 174 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aff2O55112 1272 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01673 111 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hk1P17710 974 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd7P26516 321 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3cP29621 417 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp3ccP48455 513 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa8P50706 81 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a1P53986 493 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb14Q149L6 379 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec31bQ3TZ89 1158 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Six3Q62233 333 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem252Q8C353 183 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nae1Q8VBW6 534 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ten1Q9D7K2 161 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgn3Q9DCB1 99 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NplQ9DCJ9 320 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr3bQ9JHJ5 437 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nt5cQ9JM14 200 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B9d1Q9R1S0 204 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htatip2Q9Z2G9 242 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brca2P97929 3329 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mroh7A2AVR2 1279 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930444G20RikD3Z741 495 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grk4O70291 574 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b8P07628 261 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adrb1P34971 466 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 F8a1Q00558 380 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3gQ5I2A0 440 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gas6Q61592 674 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amer3Q6NS69 780 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr26Q7TRB7 308 aa12.5□□□□□ -0.41
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo48Q8CAT8 161 aa12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms