RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arl14Q3SXC5 192 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tgtp2Q3T9E4 415 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tgtp1Q62293 415 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wipi2Q80W47 445 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rcn3Q8BH97 328 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clrn3Q8BHH8 226 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BpifcQ8C186 509 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Elf5Q8VDK3 253 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NepnQ9CQ76 512 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Haus5Q9D786 619 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Phf10Q9D8M7 497 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptges3lQ9D9A7 131 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Timp4Q9JHB3 224 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DguokQ9QX60 277 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpl3lE9PWZ3 407 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Spp1P10923 294 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp2f2P33267 491 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gngt2Q61017 69 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MelkQ61846 643 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm7247Q6UY52 187 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Celf3Q8CIN6 465 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 VitQ8VHI5 650 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cers2Q924Z4 380 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Metap1dQ9CPW9 335 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mettl7bQ9DD20 244 aa19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aldoart2A6ZI47 364 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm6502L7N456 481 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RfngO09009 332 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arl6O88848 186 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prickle1Q3U5C7 832 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dclk2Q6PGN3 756 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfap97Q6ZPR1 541 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tas2r106Q7M724 308 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Itih5Q8BJD1 952 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrch3Q8BVU0 778 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpr22Q8BZL4 432 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndel1Q9ERR1 345 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gabrr3B2RXA8 464 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm21293E9Q4G9 266 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gna12P27600 379 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Erp29P57759 262 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prss36Q5K2P8 849 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lingo3Q6GQU6 589 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Efr3aQ8BG67 819 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Noc4lQ8BHY2 516 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp940Q8R2Q3 566 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Oas1cQ924S2 362 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PdgfdQ925I7 370 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sytl2Q99N50 950 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kbtbd12Q9D618 625 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700034I23RikQ9D9Q3 184 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhox2bA2A447 191 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhox2cA2AWL9 191 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Maml2F6U238 1170 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cd247P24161 164 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aff3P51827 1254 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nudt1P53368 156 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgap39P59281 1107 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 WasP70315 520 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nfe2Q07279 373 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TsnQ62348 228 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Angptl1Q640P2 490 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tusc1Q673H1 205 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Susd6Q8BGE4 302 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sephs1Q8BH69 392 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr677Q8VF06 312 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nacc2Q9DCM7 586 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Asb4Q9WV71 426 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ttll9A2APC3 461 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn2r121A2BE32 847 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r238E9Q373 306 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dsg3O35902 993 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ldb2O55203 373 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TubP50586 505 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il11ra2P70225 432 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam131bQ3TY60 332 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CcncQ62447 283 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pnma8aQ80VM8 430 aa19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nipal1Q8BMW7 416 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms