RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641944.1

CASC19-267, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,117 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-267	ENST00000641944	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	WASF1	Q92558	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CSF3R	Q99062	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944		A0A1W2PPM1	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SOCS2	O14508	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PPEF2	O14830	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TSPAN1	O60635	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE7	O76087	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TOMM70	O94826	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SRC	P12931	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SSTR2	P30874	369 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	HOXC13	P31276	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	HSPA4	P34932	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ABCG1	P45844	678 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CAPZA1	P52907	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CTSC	P53634	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE1	Q13065	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE4	Q13068	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	3e-11	■□□□□ 10.6
CASC19-267	ENST00000641944	NR1D2	Q14995	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ETFDH	Q16134	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	C11orf88	Q6PI97	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PCYT2	Q99447	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CCDC188	H7C350	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	T	O15178	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	XRCC3	O43542	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	BMX	P51813	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PDE1B	Q01064	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SCN1B	Q07699	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944		Q0VFX4	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	EGFL8	Q99944	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	STK26	Q9P289	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PTPRC	P08575	1304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944		A0A1W2PP11	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-267	ENST00000641944	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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