RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 BORCS5Q969J3 196 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RMDN1Q96DB5 314 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 LINGO1Q96FE5 620 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ACOX2Q99424 681 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SEPHS2Q99611 448 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 C1orf50Q9BV19 199 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TLR9Q9NR96 1032 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TBC1D23Q9NUY8 699 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 VWA8A3KMH1 1905 aa10.01□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A0D9SEW6 157 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKRD28O15084 1053 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ACSL4O60488 711 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NIPSNAP2O75323 286 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SEC14L2O76054 403 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PRLP01236 227 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ESR1P03372 595 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ALPLP05186 524 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 INHBBP09529 407 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 JAK1P23458 1154 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MC4RP32245 332 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CASP2P42575 452 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PTGER3P43115 390 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OXCT1P55809 520 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ERVPABLB-1P60509 514 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 EPS8Q12929 822 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 C16orf72Q14CZ0 275 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TGFBIQ15582 683 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PYCR3Q53H96 274 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FBXO48Q5FWF7 155 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 BROXQ5VW32 411 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SCIMPQ6UWF3 145 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RNF165Q6ZSG1 346 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TMEM26Q6ZUK4 368 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CARNMT1Q8N4J0 409 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DTWD1Q8N5C7 304 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CDYL2Q8N8U2 506 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR52E4Q8NGH9 312 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TBC1D15Q8TC07 691 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NSMCE3Q96MG7 304 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CGREF1Q99674 301 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GORASP2Q9H8Y8 452 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PALMDQ9NP74 551 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 USP22Q9UPT9 525 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 H3BNC9 293 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 THRBP10828 461 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MSH3P20585 1137 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RGRP47804 291 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR1G1P47890 313 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CHRNB3Q05901 458 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MOGQ16653 247 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CLLU1OSQ5K130 101 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TTC23Q5W5X9 447 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CYP20A1Q6UW02 462 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC24A5Q71RS6 500 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RASAL3Q86YV0 1011 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 HOMEZQ8IX15 550 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PIANPQ8IYJ0 282 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 STK40Q8N2I9 435 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TTC9BQ8N6N2 239 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ATAD1Q8NBU5 361 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OR7D4Q8NG98 312 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ITFG1Q8TB96 612 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 METTL6Q8TCB7 284 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GPR152Q8TDT2 470 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ITFG2Q969R8 447 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 TMBIM1Q969X1 311 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NRBF2Q96F24 287 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MAGED4Q96JG8 741 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MUS81Q96NY9 551 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ADGRE3Q9BY15 652 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 UGT2B28Q9BY64 529 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ACTL8Q9H568 366 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RHBDL2Q9NX52 303 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SMPD4Q9NXE4 827 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 FKBPLQ9UIM3 349 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DHRS7Q9Y394 339 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms