RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	NAXD	Q8IW45	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	DEFB124	Q8NES8	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	OR2M4	Q96R27	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	GULP1	Q9UBP9	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	CHUK	O15111	745 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	GRID2	O43424	1007 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	SIGLEC6	O43699	453 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHGA12	O60330	932 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	USP1	O94782	785 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	MYBL2	P10244	700 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	CTSE	P14091	401 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	MSH3	P20585	1137 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	MPP1	Q00013	466 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	CTBP1	Q13363	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	CENPU	Q71F23	418 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	OXR1	Q8N573	874 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	COPS8	Q99627	209 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SCARB2-222	ENST00000640634	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	IQCF5	A8MTL0	148 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634		H3BM21	787 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	TM4SF5	O14894	197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	POLB	P06746	335 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF883	P0CG24	379 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ITGB6	P18564	788 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	SSTR1	P30872	391 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ACTR1B	P42025	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC1A2	P43004	574 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ACTR1A	P61163	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR33	Q49SQ1	333 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	BBOF1	Q8ND07	529 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	NETO1	Q8TDF5	533 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	PEX13	Q92968	403 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM136A	Q96C01	138 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	ULK4	Q96C45	1275 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	KLC4	Q9NSK0	619 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	SPAST	Q9UBP0	616 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	NFU1	Q9UMS0	254 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634		U3KQA8	63 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634		B4DGG1	531 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	LMO7DN	F2Z398	122 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	VEGFD	O43915	354 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	CBFA2T3	O75081	653 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	PML	P29590	882 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	GCGR	P47871	477 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	BLK	P51451	505 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	PGGT1B	P53609	377 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	LIMK1	P53667	647 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	GPX6	P59796	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	NFE2L1	Q14494	772 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	LONRF1	Q17RB8	773 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	INSC	Q1MX18	579 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	STEAP4	Q687X5	459 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SCARB2-222	ENST00000640634	NEPRO	Q6NW34	567 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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