RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 C9orf72Q96LT7 481 aa23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 DESI2Q9BSY9 194 aa23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SEMA4CQ9C0C4 833 aa23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SDK2Q58EX2 2172 aa23.13■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD34CP0C6C1 535 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TYRP1P17643 537 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 GFERP55789 205 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TTC13Q8NBP0 860 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RTP4Q96DX8 246 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 KLHL3Q9UH77 587 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.12■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 OR2AG2A6NM03 316 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 AGAP14A8MT82 685 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PRAMEF1O95521 474 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FTCDO95954 541 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 AMD1P17707 334 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR18Q14330 331 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SPARCL1Q14515 664 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PARP6Q2NL67 630 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 LINC00303Q3SY05 128 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 KCTD11Q693B1 232 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SPC24Q8NBT2 197 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CTRCQ99895 268 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf43Q9BQ61 176 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ASB8Q9H765 288 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PILRAQ9UKJ1 303 aa23.11■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CRTAMO95727 393 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 MSH3P20585 1137 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP1A2P50993 1020 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RPE65Q16518 533 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 METRNLQ641Q3 311 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 HES6Q96HZ4 224 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ZPBPQ9BS86 351 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 APMAPQ9HDC9 416 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP46Q8IYW2 2715 aa23.1■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SGTAO43765 313 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 METTL18O95568 372 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 HALP42357 657 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PDE1BQ01064 536 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 NFE2L1Q14494 772 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 EXD3Q8N9H8 876 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 MED8Q96G25 268 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 TGM7Q96PF1 710 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 EPHA6Q9UF33 1036 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.09■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 MGAT4DA6NG13 374 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 LDB2O43679 373 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RAD1O60671 282 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 ITGB2P05107 769 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 XKR5Q6UX68 686 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 DET1Q7L5Y6 550 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 NAT14Q8WUY8 206 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RSC1A1Q92681 617 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 RAB33BQ9H082 229 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.08■■□□□ 1.29
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 AKT1P31749 480 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 CAPZBP47756 277 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP4F2P78329 520 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 BCL7AQ4VC05 210 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 IL22RA1Q8N6P7 574 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 GPR150Q8NGU9 434 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 OR2L2Q8NH16 312 aa23.07■■□□□ 1.28
PPP1CC-211ENST00000620030 EXTL1Q92935 676 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms