RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FLCN	Q8NFG4	579 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OMA1	Q96E52	524 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	POLH	Q9Y253	713 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.61	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KRT87P	A6NCN2	255 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PGK1	P00558	417 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP11A1	P05108	521 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	YWHAQ	P27348	245 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MTHFR	P42898	656 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MASP1	P48740	699 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	B2M	P61769	119 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	EMX2	Q04743	252 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CHRNB3	Q05901	458 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DDR2	Q16832	855 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CDO1	Q16878	200 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SEPHS2	Q99611	448 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LRRC3	Q9BY71	257 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		M0QYV0	167 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CXCL11	O14625	94 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RGS10	O43665	173 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	VPS4B	O75351	444 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CD4	P01730	458 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FGF4	P08620	206 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ACADM	P11310	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TALDO1	P37837	337 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HNF4A	P41235	474 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	HCAR3	P49019	387 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CDH13	P55290	713 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KEAP1	Q14145	624 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RCAN2	Q14206	197 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	ITPA	Q9BY32	194 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CEP41	Q9BYV8	373 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	COMMD8	Q9NX08	183 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		A8MT66	165 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958		K7ERI5	159 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP2C18	P33260	490 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC26A3	P40879	764 aa		10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
CPEB1-215	ENST00000617958	SOX10	P56693	466 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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