RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-218ENST00000617172 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 EXTL1Q92935 676 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SPATA13Q96N96 652 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CATSPER2Q96P56 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 KLHL3Q9UH77 587 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 AMFRQ9UKV5 643 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 TFR2Q9UP52 801 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.5□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 MGAT4DA6NG13 374 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 F5H423 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 J3QKU1 62 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 KCNN4O15554 427 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RASSF9O75901 435 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 STK17BO94768 372 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PRAMEF1O95521 474 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RALBP11234 206 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 TYRP1P17643 537 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CAPZBP47756 277 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 MC1RQ01726 317 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 KIF5AQ12840 1032 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 MAP7Q14244 749 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 GPR18Q14330 331 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CLCA4Q14CN2 919 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 TBR1Q16650 682 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 LINC00303Q3SY05 128 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PEX26Q7Z412 305 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ESX1Q8N693 406 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 EXD3Q8N9H8 876 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PMEPA1Q969W9 287 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ULK4Q96C45 1275 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 TGM7Q96PF1 710 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 FICDQ9BVA6 458 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 SEMA4CQ9C0C4 833 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RBSNQ9H1K0 784 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ASB8Q9H765 288 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 OGFRQ9NZT2 677 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ARL5AQ9Y689 179 aa9.49□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 OR2AG2A6NM03 316 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 AGAP14A8MT82 685 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CFAP99D6REC4 459 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PSMD3O43242 534 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 LIFP15018 202 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 WT1P19544 449 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PSMB4P28070 264 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 AKT1P31749 480 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CTSCP53634 463 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 GFERP55789 205 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 FOXM1Q08050 763 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RPE65Q16518 533 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 PARP6Q2NL67 630 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 GPR33Q49SQ1 333 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 BCL7AQ4VC05 210 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 BORAQ6PGQ7 559 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 OR2L2Q8NH16 312 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 UBXN4Q92575 508 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ALG3Q92685 438 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CTRCQ99895 268 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.48□□□□□ -0.89
TARDBP-218ENST00000617172 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms