RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MC1R	Q01726	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	OVGP1	Q12889	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf61	Q13536	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CST6	Q15828	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ME3	Q16798	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KAZN	Q674X7	775 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	USP45	Q70EL2	814 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NECAB1	Q8N987	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TBCK	Q8TEA7	893 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SMO	Q99835	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PFKFB2	O60825	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	LRCH4	O75427	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MATN4	O95460	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MCF2	P10911	925 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CYP3A5	P20815	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	BDNF	P23560	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ANXA13	P27216	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NAMPT	P43490	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PTH2R	P49190	550 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		Q0VFX4	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ART4	Q93070	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NACA2	Q9H009	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		K7ERI5	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TOR1B	O14657	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SLC31A1	O15431	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TRIAP1	O43715	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SLITRK3	O94933	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	SLC8A1	P32418	973 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RABIF	P47224	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NPTX2	P47972	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CCL11	P51671	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	METAP1	P53582	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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