RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GTQ1 180 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf142B7Z368 130 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TPBGLP0DKB5 382 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RBP3P10745 1247 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RASSF2P50749 326 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCT8P50990 548 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TFDP2Q14188 446 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LMNTD2Q8IXW0 634 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM71DQ8N9W8 422 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TSGA13Q96PP4 275 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PPCSQ9HAB8 311 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PKD1L2Q7Z442 2459 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 JUNDP17535 347 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ELP6Q0PNE2 266 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RASA2Q15283 850 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PCGF5Q86SE9 256 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMC2Q8NEN0 867 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LMX1AQ8TE12 382 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SAP25Q8TEE9 199 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MZB1Q8WU39 189 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB7BQ96AH8 199 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 EID2BQ96D98 161 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SPDL1Q96EA4 605 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 POM121Q96HA1 1249 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 IL12RB2Q99665 862 aa12.42□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL22O00626 93 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AP1G1O43747 822 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MTX2O75431 263 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 GNAZP19086 355 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DGKAP23743 735 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PTSQ03393 145 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF7Q14155 803 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TAZQ16635 292 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL38Q2WGJ6 581 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX44Q53QW1 395 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS13Q6UX07 377 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BBS12Q6ZW61 710 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC6Q86X45 466 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PDIK1LQ8N165 341 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DCAKDQ8WVC6 231 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR3CQ8WXA8 447 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MIPEPQ99797 713 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DMTF1Q9Y222 760 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC13CQ8NB66 2214 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPN4P29074 926 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNG1P51959 295 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LIMK1P53667 647 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DMPKQ09013 629 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NEK5Q6P3R8 708 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 IGDCC3Q8IVU1 814 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 BANPQ8N9N5 519 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 DHRS4Q9BTZ2 278 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 MANSC1Q9H8J5 431 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 GLOD4Q9HC38 313 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF22Q9HCT0 170 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CHD6Q8TD26 2715 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.41□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 NDC80O14777 642 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SIGLEC6O43699 453 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 FUCA1P04066 466 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMB4P28070 264 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CSNK1DP48730 415 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP4P1Q86T03 277 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 HEATR4Q86WZ0 1026 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SCRN2Q96FV2 425 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TSSK1BQ9BXA7 367 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YYE9 177 aa12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms