RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590977.5

EFTUD2-219, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 2,422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-219ENST00000590977 PPP3CCP48454 512 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 BNIP3Q12983 259 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 EML3Q32P44 896 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 APCDD1Q8J025 514 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ACDQ96AP0 544 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PTERQ96BW5 349 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FBXL8Q96CD0 374 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ALG14Q96F25 216 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF347Q96SE7 839 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 A8MT66 165 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CLPXO76031 633 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FGF18O76093 207 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 OLFM2O95897 454 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CD247P20963 164 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FDXRP22570 491 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 GABRR2P28476 465 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TMBIM6P55061 237 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CDH15P55291 814 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 NFATC3Q12968 1075 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 KLF10Q13118 480 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF846Q147U1 533 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ISCA2Q86U28 154 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 KDM1BQ8NB78 822 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 KYQ8NBH2 561 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 LRRC3Q9BY71 257 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ZBP1Q9H171 429 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ALG9Q9H6U8 611 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 VPS51Q9UID3 782 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 NOTCH4Q99466 2003 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 AREL1O15033 823 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SLC22A2O15244 555 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 HDAC3O15379 428 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 KRT34O76011 436 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PRAMEF12O95522 483 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ME2P23368 584 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 KRT6CP48668 564 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 STC1P52823 247 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 THOP1P52888 689 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PRKAA2P54646 552 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 DNAJB13P59910 316 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TUBA1BP68363 451 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PRKAA1Q13131 559 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SELENBP1Q13228 472 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TUBA1AQ71U36 451 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 EFHBQ8N7U6 833 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PEX13Q92968 403 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 PHF21BQ96EK2 531 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RMND5AQ9H871 391 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 M0QX08 132 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 MYO1DO94832 1006 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 BCL10O95999 233 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ARSAP15289 507 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 CCNA2P20248 432 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 RAB39AQ14964 217 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 ACAP2Q15057 778 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 NRF1Q16656 503 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-219ENST00000590977 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms