RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.95□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.95□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.026e-11■■■■□ 22.8
IFT20-216ENST00000588477 VCLP18206 1134 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ITGA1P56199 1179 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TUBB4BP68371 445 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TUBB2AQ13885 445 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 PLCL1Q15111 1095 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ASIC2Q16515 512 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MED25Q71SY5 747 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 IQCKQ8N0W5 287 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 D2HGDHQ8N465 521 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 FATE1Q969F0 183 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TRIM11Q96F44 468 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 RANBP9Q96S59 729 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 RAD18Q9NS91 495 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TCFL5Q9UL49 500 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MYO6Q9UM54 1294 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.94□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TLCD2A6NGC4 264 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MYBL1P10243 752 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 VAV2P52735 878 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GSDMDP57764 484 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 DSELQ8IZU8 1212 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CCNYQ8ND76 341 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GDAP1Q8TB36 358 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 FAM71BQ8TC56 605 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 NLNQ9BYT8 704 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ZNF711Q9Y462 761 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.93□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 F5H423 210 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MEN1O00255 615 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 BPIP17213 487 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 RRADP55042 308 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GTF2H3Q13889 308 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 DPYSL3Q14195 570 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 RPE65Q16518 533 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 KYNUQ16719 465 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ZBTB2Q8N680 514 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 OR8K5Q8NH50 307 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CPT1BQ92523 772 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SGSM3Q96HU1 749 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 TTC25Q96NG3 672 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 LRFN5Q96NI6 719 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CD180Q99467 661 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ISCUQ9H1K1 167 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 OR5K3A6NET4 321 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 KCNK1O00180 336 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CAPN1P07384 714 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SKILP12757 684 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 GJC1P36383 396 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ARSEP51690 589 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 MYL5Q02045 173 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CDK18Q07002 472 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ATP1A4Q13733 1029 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 PCSK7Q16549 785 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 AMZ2Q86W34 360 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 SLC34A3Q8N130 599 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 CNTD1Q8N815 330 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-216ENST00000588477 HDAC11Q96DB2 347 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms