RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	CXCL12	P48061	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TKTL1	P51854	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TPM4	P67936	248 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	COG7	P83436	770 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	GAD2	Q05329	585 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TCF15	Q12870	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SYCP1	Q15431	976 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TAF5	Q15542	800 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TECTA	O75443	2155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A1W2PPH5	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	BECN2	A8MW95	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792		O00370	1275 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	PLOD2	O00469	737 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	OLFM2	O95897	454 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MT-ND3	P03897	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	APOD	P05090	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	HMBS	P08397	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SP9	P0CG40	484 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	NBL1	P41271	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MSH2	P43246	934 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ACADSB	P45954	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CD151	P48509	253 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TRPC1	P48995	793 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	RGS7	P49802	495 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LIMK1	P53667	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SCAND1	P57086	179 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MYL5	Q02045	173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	KDSR	Q06136	332 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	MTAP	Q13126	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CNGA2	Q16280	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ZNF540-204	ENST00000586792	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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