RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 IFNKQ9P0W0 207 aa25.07■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa25.07■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FLNCQ14315 2725 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 AKR1B10O60218 316 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 VPS4BO75351 444 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TIAF1O95411 115 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TPM3P06753 285 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TNNT1P13805 278 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FOLR1P15328 257 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SPAM1P38567 509 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RPS15P62841 145 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SLC41A2Q96JW4 573 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 VPS4AQ9UN37 437 aa25.06■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SYCE3A1L190 88 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TTLL8A6PVC2 850 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 POP7O75817 140 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 EBLN1P0CF75 366 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP25P42331 645 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 CD97P48960 835 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 XRCC4Q13426 336 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RPE65Q16518 533 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 KMT5CQ86Y97 462 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 GPR150Q8NGU9 434 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TEKT5Q96M29 485 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K3Q99759 626 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 GPR87Q9BY21 358 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 IL26Q9NPH9 171 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FGF21Q9NSA1 209 aa25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 BLACEA4D250 179 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 OR2AG2A6NM03 316 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DNAJB5O75953 348 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PTPN3P26045 913 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DMPKQ09013 629 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SEMA5AQ13591 1074 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ITGA9Q13797 1035 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ARMC6Q6NXE6 501 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 THAP4Q8WY91 577 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 CD180Q99467 661 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 HACD3Q9P035 362 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PKP3Q9Y446 797 aa25.04■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 LRRK2Q5S007 2527 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TLCD2A6NGC4 264 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 WNT3AP56704 352 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 NFE2L1Q14494 772 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 NOMO1Q15155 1222 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 CHRNA6Q15825 494 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 OOSP2Q86WS3 158 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RHOT1Q8IXI2 618 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 ACSS2Q9NR19 701 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SEMA5BQ9P283 1151 aa25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UGT1A9O60656 530 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UGT1A6P19224 532 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 NFKB1P19838 968 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UGT1A1P22309 533 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UGT1A4P22310 534 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PTPN4P29074 926 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 AKT1P31749 480 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 NR2C2P49116 596 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PGDP52209 483 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 CTSCP53634 463 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 RPS18P62269 152 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 HSD11B2P80365 405 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 UGT8Q16880 541 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 TMTC4Q5T4D3 741 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 LRRC38Q5VT99 294 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 SYVN1Q86TM6 617 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DDHD1Q8NEL9 900 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.02■■□□□ 1.6
E2F4-213ENST00000569573 MR1Q95460 341 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms