RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 TMEM245Q9H330 911 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 OBP2AQ9NY56 170 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 GIMAP2Q9UG22 337 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 BTRCQ9Y297 605 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 WNT9AO14904 365 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 GIPC1O14908 333 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 KATNA1O75449 491 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 DGKAP23743 735 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 ATP5HO75947 161 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 CTSCP53634 463 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CNTN1Q12860 1018 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SBSNQ6UWP8 590 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 MACC1Q6ZN28 852 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 VRK3Q8IV63 474 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 ELMO1Q92556 727 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 FOXJ1Q92949 421 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 PANX3Q96QZ0 392 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.3□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 AGAP14A8MT82 685 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 MID1O15344 667 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 C6P13671 934 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CD72P21854 359 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.089e-7■■■■□ 24.6
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CS-215ENST00000549143 P2RY2P41231 377 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 NME5P56597 212 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SLC25A3Q00325 362 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 TEX9Q8N6V9 391 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CDYL2Q8N8U2 506 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 KLK6Q92876 244 aa8.29□□□□□ -1.08
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CS-215ENST00000549143 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 DKK3Q9UBP4 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 MUC3AQ02505 3323 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PP55 124 aa8.29□□□□□ -1.08
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