RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A4P31645 630 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FOXN2P32314 431 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PHBP35232 272 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MSH2P43246 934 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MAGEA11P43364 429 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC18A1P54219 525 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CCL23P55773 120 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TPI1P60174 286 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RAB1AP62820 205 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 AP1B1Q10567 949 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FGL2Q14314 439 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC1A5Q15758 541 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FUT10Q6P4F1 479 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CYS1Q717R9 158 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MED25Q71SY5 747 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PID1Q7Z2X4 250 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 VPS52Q8N1B4 723 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NUP93Q8N1F7 819 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 STKLD1Q8NE28 680 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MGARPQ8TDB4 240 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ARNTL2Q8WYA1 636 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SEPT8Q92599 483 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SLC39A13Q96H72 371 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 B3GALT6Q96L58 329 aa5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 TSGA13Q96PP4 275 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 HAPLN3Q96S86 360 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TMEM175Q9BSA9 504 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TRABDQ9H4I3 376 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PPCSQ9HAB8 311 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 DKK2Q9UBU2 259 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 OR12D3Q9UGF7 316 aa5.49□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SCML2Q9UQR0 700 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RAD54BQ9Y620 910 aa5.49□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MGAMO43451 1857 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MTMR11A4FU01 709 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CAPN8A6NHC0 703 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 FAM159BA6NKW6 160 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RASA4BC9J798 803 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD65E5RJM6 399 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 F5H423 210 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 MASP2O00187 686 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RNF103O00237 685 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 EBAG9O00559 213 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RASA4O43374 803 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CACNG3O60359 315 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 SOAT2O75908 522 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 NCR1O76036 304 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 SUN1O94901 812 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-205ENST00000546248 APRTP07741 180 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CCL5P13501 91 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 RHCEP18577 417 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PSMB4P28070 264 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 EPHB2P29323 1055 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CYP2C18P33260 490 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 PBX3P40426 434 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CHN2P52757 468 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-205ENST00000546248 CDK16Q00536 496 aa5.48□□□□□ -1.53
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