RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	MS4A14	Q96JA4	679 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GBA3	Q9H227	469 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IL26	Q9NPH9	171 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IL17C	Q9P0M4	197 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SPAST	Q9UBP0	616 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARL5A	Q9Y689	179 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RP1	P56715	2156 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PQ67	120 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048		A6NCN8	305 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C5orf60	A6NFR6	353 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HACD1	B0YJ81	288 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TOR1B	O14657	336 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGAP6	O43182	974 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LIAS	O43766	372 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	MPO	P05164	745 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	IVL	P07476	585 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ANXA6	P08133	673 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HGF	P14210	728 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	JUP	P14923	745 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BRAF	P15056	766 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF30	P17039	623 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ITPKB	P27987	946 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	HTR1B	P28222	390 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TEAD1	P28347	426 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KCNJ1	P48048	391 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GSDMD	P57764	484 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR1D5	P58170	312 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	DAB2	P98082	770 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	XIAP	P98170	497 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	B4GALNT1	Q00973	533 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SNX1	Q13596	522 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PEX6	Q13608	980 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC14A2	Q15849	920 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PAOX	Q6QHF9	649 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARL14	Q8N4G2	192 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	TBATA	Q96M53	351 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SPATA13	Q96N96	652 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	OR2AG1	Q9H205	316 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	KCNK6	Q9Y257	313 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	ACACA	Q13085	2346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	PTPRB	P23467	1997 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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