RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540475.5

SEMA4D-223, Transcript of semaphorin 4D, human

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATP5O	P48047	213 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	VAV2	P52735	878 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GFER	P55789	205 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	XIAP	P98170	497 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ABHD18	Q0P651	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GTF2H3	Q13889	308 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GPR18	Q14330	331 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM139	Q8IV31	216 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ALG3	Q92685	438 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	EXTL1	Q92935	676 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	APMAP	Q9HDC9	416 aa		12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	C2orf81	A6NN90	581 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GPR39	O43194	453 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TYRP1	P17643	537 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CYP4F2	P78329	520 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PDE1B	Q01064	536 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	IL11RA	Q14626	422 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PTPRCAP	Q14761	206 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	RPE65	Q16518	533 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	BCL7A	Q4VC05	210 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	KCTD11	Q693B1	232 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GDAP1	Q8TB36	358 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	SPATA13	Q96N96	652 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	TTC25	Q96NG3	672 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FICD	Q9BVA6	458 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ARL5A	Q9Y689	179 aa		12.85	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	MGAT4D	A6NG13	374 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475		F5H423	210 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	KCNN4	O15554	427 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	STK17B	O94768	372 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	FGF5	P12034	268 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	AMD1	P17707	334 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PSMA3	P25788	255 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PSMB4	P28070	264 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CETN2	P41208	172 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	HAL	P42357	657 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	MAPK9	P45984	424 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRPSAP1	Q14558	356 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR2L2	Q8NH16	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	RSC1A1	Q92681	617 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CATSPER2	Q96P56	530 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	CTRC	Q99895	268 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.84	□□□□□ -0.35
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR2AG2	A6NM03	316 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475		H7C0S8	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475		J3QKU1	62 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	LDB2	O43679	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	CRTAM	O95727	393 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	STAT5A	P42229	794 aa		12.83	□□□□□ -0.36
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36

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