RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 DBN1Q16643 649 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.62■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 LAYNQ6UX15 382 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 PACS1Q6VY07 963 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.62■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 HEATR4Q86WZ0 1026 aa16.62■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 CA5BQ9Y2D0 317 aa16.61■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 TTC1Q99614 292 aa16.6■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 COPS8Q99627 209 aa16.6■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.6■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.6■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 WNT1P04628 370 aa16.59■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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PACS1-208ENST00000529677 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 LRRC6Q86X45 466 aa16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 RBFAQ8N0V3 343 aa16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 OR13H1Q8NG92 308 aa16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.59■□□□□ 0.25
PACS1-208ENST00000529677 TTC9Q92623 222 aa16.59■□□□□ 0.25
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