RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RANBP10Q6VN20 620 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NPWQ8N729 165 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PAF1Q8N7H5 531 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2T12Q8NG77 320 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SUN5Q8TC36 379 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB18Q99592 522 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WDCPQ9H6R7 721 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTR8Q9H981 624 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBBXA8MT70 800 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 H3BMM5 538 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GUCY1B2O75343 617 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNK2O95069 426 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 C22orf31O95567 290 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TCF3P15923 654 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CD36P16671 472 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 AGXTP21549 392 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 BDNFP23560 247 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 IGFBP5P24593 272 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CXCR2P25025 360 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CHRNA5P30532 468 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NR4A2P43354 598 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TAF6P49848 677 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SUOXP51687 545 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CLCN3P51790 818 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CDH13P55290 713 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OLR1P78380 273 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CDC42EP1Q00587 391 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FCHO2Q0JRZ9 810 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC13A2Q13183 592 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 STARD3Q14849 445 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB6Q15916 424 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PYCR3Q53H96 274 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DESI1Q6ICB0 168 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MRNIPQ6NTE8 343 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 XKRXQ6PP77 449 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OTOP3Q7RTS5 596 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM126BQ8IXS8 530 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MICU2Q8IYU8 434 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FLCNQ8NFG4 579 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OR56A4Q8NGH8 313 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM162AQ96A26 154 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TP53INP1Q96A56 240 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM74Q96NL1 305 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF38Q9H0F5 515 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ACOT13Q9NPJ3 140 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 RGS18Q9NS28 235 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 STMN3Q9NZ72 180 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.44□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2A25A4D2G3 310 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 ASPDHA6ND91 283 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM72CH0Y354 149 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 WNT10BO00744 389 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 AIREO43918 545 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 DFNA5O60443 496 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM20BO75063 409 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MFN2O95140 757 aa7.43□□□□□ -1.22
HMBOX1-211ENST00000524238 MT-ND1P03886 318 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms