RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTTG2Q9NZH5 202 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL9Q9P2J3 617 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF11Q9UIL8 331 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MUC12Q9UKN1 5478 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA14Q9ULX7 337 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASTN1O14525 1302 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PR80 420 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM234BA2RU67 622 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM231BA6NCW3 169 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBY3A6NI87 242 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGAP5A6NIR3 686 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC38A8A6NNN8 435 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ISM1B1AKI9 464 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 E9PAM4 449 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 G3V2L1 256 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNM1LO00429 736 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP2C2O75185 946 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 OFD1O75665 1012 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPP40O75818 363 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBXN7O94888 489 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV1-47P01700 117 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFAP2AP05549 437 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF286BP0CG31 522 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPN1P15169 458 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCF3P15923 654 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTNR1AP48039 350 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEOX2P50222 304 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RCAN1P53805 252 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARSFP54793 590 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN20P56880 219 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 COG7P83436 770 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF6Q15052 776 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 LTB4RQ15722 352 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNGA2Q16280 664 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRAGBQ5VZM2 374 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOA5Q6Q788 366 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q75L30 129 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTN2A1Q7KYR7 527 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRSK2Q8IWQ3 736 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYOCDQ8IZQ8 938 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYT14Q8NB59 555 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 THAP6Q8TBB0 222 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 TADA1Q96BN2 335 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERLEC1Q96DZ1 483 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MSLNLQ96KJ4 702 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX22Q96L94 193 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 C16orf70Q9BSU1 422 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 KATNAL1Q9BW62 490 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAAP1Q9H8G2 361 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR6C68A6NDL8 312 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF878C9JN71 531 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLRF2D3W0D1 207 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLGAP1O14490 977 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP6V0E1O15342 81 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 FFAR2O15552 330 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRAK2O43187 625 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBX6O95503 412 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACTL6AO96019 429 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 UMPSP11172 480 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD58P19256 250 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELK3P41970 407 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIG4P49917 911 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP4BP51164 291 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUOXP51687 545 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD23BP54727 409 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 STX17P56962 302 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRM4Q14833 912 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPECC1Q5M775 1068 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYDE2Q5VT97 1194 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LEMD1Q68G75 181 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGBD2Q6P3X8 592 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PACS1Q6VY07 963 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2CD5Q86YS7 1000 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP7D3Q8IWC1 876 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF786Q8N393 782 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARVELD2Q8N4S9 558 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF525Q8N782 197 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF615Q8N8J6 731 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLIS1Q8NBF1 620 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETD9Q8NE22 299 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJC3Q8NFK1 279 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 IMMP1LQ96LU5 166 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGAT2Q96PD7 388 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 OLFM1Q99784 485 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRMDAQ9H2I8 198 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 JPT2Q9H910 190 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 BABAM1Q9NWV8 329 aa-1.04□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms