RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBE2B-208ENST00000511807 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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