RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ALOX12P18054 663 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 MAPK8P45983 427 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ACADVLP49748 655 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ZBED5Q49AG3 693 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF605Q86T29 641 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PACRGLQ8N7B6 248 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NELL1Q92832 810 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ATG10Q9H0Y0 220 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 MEAF6Q9HAF1 191 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 KRT84Q9NSB2 600 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SCML2Q9UQR0 700 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SCN9AQ15858 1988 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 RPIAP49247 311 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SLCO6A1Q86UG4 719 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 BBS7Q8IWZ6 715 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 OR8H2Q8N162 312 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB2Q8N680 514 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PLEKHA8Q96JA3 519 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 KLHL32Q96NJ5 620 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 FNIP2Q9P278 1114 aa13.1□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 LCHNA4D1U4 455 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 IGFBP5P24593 272 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 KIR3DL1P43629 444 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 INHBEP58166 350 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CNTN1Q12860 1018 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 LSAMPQ13449 338 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CGREF1Q99674 301 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SYT17Q9BSW7 474 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ABCB10Q9NRK6 738 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PDE10AQ9Y233 779 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 A0A0D9SEW6 157 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 BCKDKO14874 412 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 FFAR2O15552 330 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ANGPTL1O95841 491 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 DBTP11182 482 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 FGD3Q5JSP0 725 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 RGMBQ6NW40 437 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 RAB42Q8N4Z0 105 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 TNKS2Q9H2K2 1166 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SELENONQ9NZV5 590 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CXCR6O00574 342 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SEPT4O43236 478 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CD1DP15813 335 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 UGT1A1P22309 533 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 UGT1A4P22310 534 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 JAK1P23458 1154 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 UGT1A3P35503 534 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 UGT1A5P35504 534 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 BNIP3Q12983 259 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 DAG1Q14118 895 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CLDN19Q8N6F1 224 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PSMA8Q8TAA3 256 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 40.5
SPCS3-201ENST00000503362 BIRC7Q96CA5 298 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.09□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CLDN9O95484 217 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SPATA31D3P0C874 917 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CDH3P22223 829 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 HPCAL1P37235 193 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CCR3P51677 355 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CYP4F2P78329 520 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 CYP4F3Q08477 520 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NAT16Q8N8M0 369 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 IGSF8Q969P0 613 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 TMBIM1Q969X1 311 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NODALQ96S42 347 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.08□□□□□ -0.31
SPCS3-201ENST00000503362 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.08□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 H3BN98 237 aa13.08□□□□□ -0.32
SPCS3-201ENST00000503362 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms