RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495645.5

CHPF2-204, Transcript of chondroitin polymerizing factor 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHPF2, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2-204ENST00000495645 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.65□□□□□ -0.06
CHPF2-204ENST00000495645 NUMA1Q14980 2115 aa14.65□□□□□ -0.06
CHPF2-204ENST00000495645 TMEM114B3SHH9 223 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 VPS26AO75436 327 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 AOC1P19801 751 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ITGAXP20702 1163 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 POLD2P49005 469 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PHKG1Q16816 387 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TMEM202A6NGA9 273 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 OR2AG2A6NM03 316 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 AIM2O14862 343 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 INPP4BO15327 924 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 CDK14O94921 469 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TIMP2P16035 220 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ACRV1P26436 265 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 RAD51Q06609 339 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PRKAA1Q13131 559 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 VRK3Q8IV63 474 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 NUDT8Q8WV74 236 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ZNF225Q9UK10 706 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 F8W8V4 182 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 K7ESM1 405 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 IMPDH1P20839 514 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SPAM1P38567 509 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PTGER3P43115 390 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 IL2P60568 153 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TRIP10Q15642 601 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 USP45Q70EL2 814 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SNX20Q7Z614 316 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SDHDO14521 159 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FGF19O95750 216 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ITGALP20701 1170 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PSMA3P25788 255 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PIK3CGP48736 1102 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 NXPE1Q8N323 547 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 KIAA1191Q96A73 305 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TCF12Q99081 682 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 POMPQ9Y244 141 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 CFLARO15519 480 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 CSNK1DP48730 415 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SPINT3P49223 89 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 HERVK_113P63132 956 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 KCNJ9Q92806 393 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 GBP5Q96PP8 586 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 CD274Q9NZQ7 290 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DEC1Q9P2X7 70 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FBXO10Q9UK96 956 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.63□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 GRIA2P42262 883 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 PKNOX1P55347 436 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 DERL2Q9GZP9 239 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 MID2Q9UJV3 735 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.62□□□□□ -0.07
CHPF2-204ENST00000495645 OR6B1O95007 311 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms