RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 DSC2Q02487 901 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM135Q86UB9 458 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TTC13Q8NBP0 860 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 DTLQ9NZJ0 730 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.74■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CDC14CA4D256 554 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 VPS4BO75351 444 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 KATNA1O75449 491 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PDGFAP04085 211 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CCNCP24863 283 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 OLFM3Q96PB7 478 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TGM7Q96PF1 710 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 VPS4AQ9UN37 437 aa22.73■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 USP27XA6NNY8 438 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CES2O00748 559 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 AGFG2O95081 481 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GPR89BP0CG08 455 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 TYRP1P17643 537 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SEPHS1P49903 392 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 GBE1Q04446 702 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 XRCC4Q13426 336 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SEMA5AQ13591 1074 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 DNASE1L3Q13609 305 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 FHL5Q5TD97 284 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 P3H4Q92791 437 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 RNF31Q96EP0 1072 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 KLC4Q9NSK0 619 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PADI1Q9ULC6 663 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.72■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 LRBAP50851 2863 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 HACD1B0YJ81 288 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 MATN3O15232 486 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 SPAG6O75602 509 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 VIPP01282 170 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 MT-ND3P03897 115 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.71■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC19A1P41440 591 aa22.71■■□□□ 1.23
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SIMC1-208ENST00000495423 SLC35F6Q8N357 371 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PBKQ96KB5 322 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.71■■□□□ 1.23
SIMC1-208ENST00000495423 PIPSLA2A3N6 862 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 TTLL8A6PVC2 850 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 C21orf140B9A014 251 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CHUKO15111 745 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 AMD1P17707 334 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CAPZBP47756 277 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 QPCTQ16769 361 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 KAZNQ674X7 775 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 SEC14L1Q92503 715 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 OR2AG1Q9H205 316 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 LHX9Q9NQ69 397 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.7■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 SPTBP11277 2137 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 RASSF9O75901 435 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB4AP04350 444 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R3BQ86XI6 285 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.69■■□□□ 1.22
SIMC1-208ENST00000495423 CT55Q8WUE5 264 aa22.69■■□□□ 1.22
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