RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495087.5

RAD18-210, Transcript of RAD18, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 4

Gene RAD18, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18-210ENST00000495087 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 CCNJLQ8IV13 435 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 SFRP1Q8N474 314 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 SNF8Q96H20 258 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 TTC1Q99614 292 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 CLCA2Q9UQC9 943 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 WDR37Q9Y2I8 494 aa11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RAD18-210ENST00000495087 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.71□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 PRR19A6NJB7 356 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 B4GAT1O43505 415 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KCNJ13O60928 360 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 BRAFP15056 766 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ITGB6P18564 788 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 PAMP19021 973 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ARNTP27540 789 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 NSG1P42857 185 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MAGEA3P43357 314 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SHC2P98077 582 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SPIDRQ14159 915 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CLCA4Q14CN2 919 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 BRD3Q15059 726 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MSS51Q4VC12 460 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SPRED1Q7Z699 444 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 HOOK3Q86VS8 718 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 OR2L2Q8NH16 312 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SIGLEC10Q96LC7 697 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SLC38A3Q99624 504 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CCM2Q9BSQ5 444 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.7□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 RP1P56715 2156 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SPTBN2O15020 2390 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 A0A0G2JNG1 304 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 A0A1W2PQM1 296 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MAGEB16A2A368 324 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 OR5K4A6NMS3 321 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 AGRPO00253 132 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CSO75390 466 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 NDUFS3O75489 264 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 AP2A2O94973 939 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 VIPP01282 170 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 TUBB4AP04350 444 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 PNLIPP16233 465 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SLC19A1P41440 591 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 HALP42357 657 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MAPK9P45984 424 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 DMPKQ09013 629 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIR2DS5Q14953 304 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 MORF4L2Q15014 288 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 NAPRTQ6XQN6 538 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 USP53Q70EK8 1073 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 KIF18AQ8NI77 898 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 SGSM3Q96HU1 749 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ERP44Q9BS26 406 aa11.69□□□□□ -0.54
RAD18-210ENST00000495087 ZMYND15Q9H091 742 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms