RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 K7ENP7 123 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 EPHB6O15197 1021 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXS1O43638 330 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC14BO60729 498 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RAMP2O60895 175 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TMCC1O94876 653 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT2B4P06133 528 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT3P12035 628 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TSHRP16473 764 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CR2P20023 1033 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SDC4P31431 198 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK7P49862 253 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TMPRSS3P57727 454 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ROM1Q03395 351 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CFHR1Q03591 330 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf61Q13536 156 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PTK2BQ14289 1009 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CYTH1Q15438 398 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR59Q6PJI9 974 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MACC1Q6ZN28 852 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC185Q8N715 623 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 IL12RB2Q99665 862 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC61Q9BV99 259 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10A2Q9H208 303 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 THSD1Q9NS62 852 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FANCLQ9NW38 375 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PADI4Q9UM07 663 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SATB2Q9UPW6 733 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.4□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 BSNQ9UPA5 3926 aa6.4□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MYLKQ15746 1914 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP69A5D8W1 941 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RASA4BC9J798 803 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 NEMP1O14524 444 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 DVL2O14641 736 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MUSKO15146 869 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 INSIG1O15503 277 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK10O43240 276 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 RASA4O43374 803 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TM7SF2O76062 418 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 GFPT2O94808 682 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 ANXA6P08133 673 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SOX5P35711 763 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CSNK1DP48730 415 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SUOXP51687 545 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 HK3P52790 923 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PPARDQ03181 441 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT31Q15323 416 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TBR1Q16650 682 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 UGP2Q16851 508 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 CDO1Q16878 200 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 BROXQ5VW32 411 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 MON1BQ7L1V2 547 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS36Q86VN1 386 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 C3orf20Q8ND61 904 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR156Q8NFN8 814 aa6.39□□□□□ -1.39
PRPF40A-210ENST00000489741 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms