RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LAPTM5Q13571 262 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PCSK7Q16549 785 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ELMOD1Q8N336 334 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GOLM1Q8NBJ4 401 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PSD4Q8NDX1 1056 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TNFRSF10AO00220 468 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 DYRK3O43781 588 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 HS6ST1O60243 411 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MAFKO60675 156 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 F9P00740 461 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 HLA-DQB2P05538 268 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 UMPSP11172 480 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PRKACGP22612 351 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TGFBR1P36897 503 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CSRP3P50461 194 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CHRNB3Q05901 458 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 E2F2Q14209 437 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FAM209AQ5JX71 171 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 COLEC12Q5KU26 742 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PKN3Q6P5Z2 889 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SPESP1Q6UW49 350 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SYTL1Q8IYJ3 562 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ABI1Q8IZP0 508 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MCFD2Q8NI22 146 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ITFG1Q8TB96 612 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 KIFC1Q9BW19 673 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 IGSF5Q9NSI5 407 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 AASSQ9UDR5 926 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TCRBV5S2A0A599 114 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 H0Y626 953 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TRIM16O95361 564 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 RBP1P09455 135 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PPP5CP53041 499 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OR4D2P58180 307 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SH3BP2P78314 561 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ITCHQ96J02 903 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CPNE5Q9HCH3 593 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LAMA3Q16787 3333 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LRRC14BA6NHZ5 514 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SLC4A1P02730 911 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CHRNB1P11230 501 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 NAT1P18440 290 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PCSK1P29120 753 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FOXA1P55317 472 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 KCNAB2Q13303 367 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PCID2Q5JVF3 399 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FAM171BQ6P995 826 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SCIMPQ6UWF3 145 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PIK3C3Q8NEB9 887 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FBXO30Q8TB52 745 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CNIH3Q8TBE1 160 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ATL1Q8WXF7 558 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TXNDC15Q96J42 360 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 DSN1Q9H410 356 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 NTN4Q9HB63 628 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 NMUR1Q9HB89 426 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 OSER1Q9NX31 292 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 SCN4AP35499 1836 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 CCL22O00626 93 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 MTSS1O43312 755 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 B4GALT3O60512 393 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 ALOX12P18054 663 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 LBPP18428 481 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 KCNC1P48547 511 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 GPR158Q5T848 1215 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-212ENST00000488380 DESI1Q6ICB0 168 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms