RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477371.5

MRPL38-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L38, human

TSL 2

Gene MRPL38, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL38-208	ENST00000477371	PPM1D	O15297	605 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	POLB	P06746	335 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	F3	P13726	295 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	IDS	P22304	550 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PML	P29590	882 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NSG1	P42857	185 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RPIA	P49247	311 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PRLHR	P49683	370 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CLCNKA	P51800	687 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CCL7	P80098	99 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ITIH4	Q14624	930 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CLCA4	Q14CN2	919 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HIF1A	Q16665	826 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	IYD	Q6PHW0	289 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PDIK1L	Q8N165	341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	WHRN	Q9P202	907 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		10.01	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PTPRB	P23467	1997 aa		10.01	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MAGEB16	A2A368	324 aa		10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	B4GAT1	O43505	415 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	OPA1	O60313	960 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NDUFS3	O75489	264 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	USP1	O94782	785 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ERVK-10	P10266	1014 aa		10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	PGAM1	P18669	254 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SLC19A1	P41440	591 aa		10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	PLTP	P55058	493 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	OR1D5	P58170	312 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	CALCOCO2	Q13137	446 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CTBP1	Q13363	440 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CRYM	Q14894	314 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	BRD3	Q15059	726 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HES3	Q5TGS1	186 aa		10	□□□□□ -0.81
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MRPL38-208	ENST00000477371	MAPK15	Q8TD08	544 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NAT6	Q93015	286 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RAB17	Q9H0T7	212 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	COG4	Q9H9E3	785 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81

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