RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PLPP2	O43688	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SYNGR3	O43761	229 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ACTN1	P12814	892 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF23	P17027	643 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	NR1D1	P20393	614 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	EMC1	Q8N766	993 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SCFD2	Q8WU76	684 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GFI1	Q99684	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ABCC1	P33527	1531 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	A2M	P01023	1474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	DVL1	O14640	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SELL	P14151	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM11	P17152	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GABRB1	P18505	474 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HRH2	P25021	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GLIPR1	P48060	266 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CAMP	P49913	170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TERF1	P54274	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MBD5	Q9P267	1494 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PTPRT	O14522	1441 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CTSV	O60911	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF217	O75362	1048 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PTP4A3	O75365	173 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PDE9A	O76083	593 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CSF2RA	P15509	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PAX1	P15863	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MSH2	P43246	934 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CTSC	P53634	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CDH8	P55286	799 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	GAD1	Q99259	594 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	MADD	Q8WXG6	1647 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NFU1-209	ENST00000474230	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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