RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SLC5A2	P31639	672 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SLC19A1	P41440	591 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	LIMK2	P53671	638 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	XIAP	P98170	497 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	KRT33B	Q14525	404 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	GSE1	Q14687	1217 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	PLCL1	Q15111	1095 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	NXPE1	Q8N323	547 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35F6	Q8N357	371 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	STYX	Q8WUJ0	223 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A14	Q96JA4	679 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	BPTF	Q12830	3046 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	OR51F1	A6NGY5	319 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	KIF5C	O60282	957 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ETV5	P41161	510 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	GRIA1	P42261	906 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CXADR	P78310	365 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	GPR33	Q49SQ1	333 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	USP7	Q93009	1102 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM159	Q96B96	161 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	TGM7	Q96PF1	710 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	WWP1	Q9H0M0	922 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	MGA	Q8IWI9	3026 aa		14.52	□□□□□ -0.08
SSR4-208	ENST00000471880	HEATR9	A2RTY3	570 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	MGAT4D	A6NG13	374 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB7	A8K855	629 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF10	O60809	474 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	KCNJ13	O60928	360 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF9	O75901	435 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	UBXN7	O94888	489 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CCL4	P13236	92 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	BRAF	P15056	766 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	EPHA4	P54764	986 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PRAME	P78395	509 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CFHR1	Q03591	330 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG1	Q06432	222 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA5A	Q13591	1074 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	LAMB3	Q13751	1172 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	GPR18	Q14330	331 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CLCA4	Q14CN2	919 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PDZD3	Q86UT5	571 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	PBK	Q96KB5	322 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf66	Q96MD2	445 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	POT1	Q9NUX5	634 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SSR4-208	ENST00000471880	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09

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