RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 PTPN3P26045 913 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 DMPKQ09013 629 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TUBB3Q13509 450 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 GTF2H3Q13889 308 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 NOMO1Q15155 1222 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RPE65Q16518 533 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 AMZ2Q86W34 360 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RFX6Q8HWS3 928 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 GPR150Q8NGU9 434 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 TTC25Q96NG3 672 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 RUFY1Q96T51 708 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 ACTL8Q9H568 366 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 IFNKQ9P0W0 207 aa22.15■■□□□ 1.14
USP4-208ENST00000464168 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A9O60656 530 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DNAJB5O75953 348 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A6P19224 532 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A1P22309 533 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A4P22310 534 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CA5AP35218 305 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CTSCP53634 463 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DYNLT1P63172 113 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SEMA5AQ13591 1074 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CHRNA6Q15825 494 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 LRRC38Q5VT99 294 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 KDELC1Q6UW63 502 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ATCAYQ86WG3 371 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MAP3K3Q99759 626 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TRABDQ9H4I3 376 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 IL17CQ9P0M4 197 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.14■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GPR39O43194 453 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 KRT1P04264 644 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ARHGAP25P42331 645 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 WNT3AP56704 352 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 KLHL35Q6PF15 583 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GPR87Q9BY21 358 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FGF21Q9NSA1 209 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.13■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SYCE3A1L190 88 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 EPOP01588 193 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 EBLN1P0CF75 366 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PTPN4P29074 926 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 CHRNA4P43681 627 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ACY1Q03154 408 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 WASHC5Q12768 1159 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.133e-7■■□□□ 13.3
USP4-208ENST00000464168 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 BLACEA4D250 179 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SPAM1P38567 509 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 LAMB3Q13751 1172 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 NFE2L1Q14494 772 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 UGT8Q16880 541 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 METRNLQ641Q3 311 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 KMT5CQ86Y97 462 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 D2HGDHQ8N465 521 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SEC14L1Q92503 715 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DNAJC7Q99615 494 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 DEF6Q9H4E7 631 aa22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 OR5K3A6NET4 321 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 OR2AG2A6NM03 316 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 NFKB1P19838 968 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 NR2C2P49116 596 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 HSD11B2P80365 405 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PLCL1Q15111 1095 aa22.1■■□□□ 1.13
USP4-208ENST00000464168 PPP2R5EQ16537 467 aa22.1■■□□□ 1.13
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