RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 SEPHS2Q99611 448 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 OCEL1Q9H607 264 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 EI24O14681 340 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 RHOAP61586 193 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CACNG1Q06432 222 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 STK40Q8N2I9 435 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 P2RY12Q9H244 342 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 ZNF711Q9Y462 761 aa20.21■□□□□ 0.83
IMP4-208ENST00000460766 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.21■□□□□ 0.83
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IMP4-208ENST00000460766 ITGB6P18564 788 aa20.2■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 ALDH3B2P48448 385 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 NR6A1Q15406 480 aa20.2■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 EID2BQ96D98 161 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 LHX3Q9UBR4 397 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CLGNO14967 610 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ACOX3O15254 700 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TBL1XO60907 577 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SEC24AO95486 1093 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CLIC3O95833 236 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 G6PDP11413 515 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MYF6P23409 242 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TUBA4AP68366 448 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SP3Q02447 781 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PLD1Q13393 1074 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 BHMTQ93088 406 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 LRRC3Q9BY71 257 aa20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GUCA1CO95843 209 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 NUDT8Q8WV74 236 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 PPM1MQ96MI6 270 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 CIPCQ9C0C6 399 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ETAA1Q9NY74 926 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 GTF2H2Q13888 395 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SLC36A3Q495N2 470 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SPRED1Q7Z699 444 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HID1Q8IV36 788 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SEPT8Q92599 483 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 VPS50Q96JG6 964 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.19■□□□□ 0.82
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IMP4-208ENST00000460766 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OR7A17O14581 309 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HRH2P25021 359 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HTR1EP28566 365 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 HMGCLP35914 325 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 OR4D2P58180 307 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 SBSNQ6UWP8 590 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 PAF1Q8N7H5 531 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 RNF145Q96MT1 663 aa20.18■□□□□ 0.82
IMP4-208ENST00000460766 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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