RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 VRK3Q8IV63 474 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PHF21BQ96EK2 531 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CDH19Q9H159 772 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MYL2P10916 166 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DPTQ07507 201 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ACAP2Q15057 778 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 VPS35Q96QK1 796 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 BTN3A1O00481 513 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 IL2P60568 153 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FBRSQ9HAH7 460 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 UBXN8O00124 270 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK14O94921 469 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 KLC3Q6P597 504 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB2Q8N680 514 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT87PA6NCN2 255 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 BIRC5O15392 142 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OR56A5P0C7T3 313 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RALBP11234 206 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SGCGQ13326 291 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SYT13Q7L8C5 426 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 INPP5DQ92835 1189 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DERL2Q9GZP9 239 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OXSMQ9NWU1 459 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM107AO95990 144 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 NAGLUP54802 743 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CLDN2P57739 230 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 HORMAD1Q86X24 394 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 FOXJ1Q92949 421 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 INVSQ9Y283 1065 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 H0Y8X5 98 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SCAMP1O15126 338 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 DLG3Q92796 817 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 EBF2Q9HAK2 575 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 GULP1Q9UBP9 304 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP99D6REC4 459 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 KITP10721 976 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 MTHFD2P13995 350 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CD9P21926 228 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 AOAHP28039 575 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC26A3P40879 764 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 DGKEP52429 567 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 HK3P52790 923 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK3Q00526 305 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB16Q05516 673 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms