RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-204ENST00000442563 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
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RABGEF1-204ENST00000442563 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
RABGEF1-204ENST00000442563 CES3Q6UWW8 571 aa16.52■□□□□ 0.24
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