RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP10Q9P2G4 905 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YCG3 227 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A7O00341 560 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 B4GALT4O60513 344 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LRIG2O94898 1065 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF15O94989 841 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 IMPDH1P20839 514 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A5P33763 92 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGAP37287 484 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIK1P39086 918 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9A3P48764 834 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH3A2P51648 485 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMK1P53667 647 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGCS2P54868 508 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DAG1Q14118 895 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 STK11Q15831 433 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF19Q2TAC6 998 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2H4Q92759 462 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAPC3Q92966 411 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ISL2Q96A47 359 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BEX2Q9BXY8 128 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX6Q9UNH7 406 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 COL4A6Q14031 1691 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NEMP2A6NFY4 417 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC154A6NI56 674 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP5A6NIR3 686 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D4O60343 1298 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NOBOXO60393 691 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN1O60635 241 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 APOA4P06727 396 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 WEE1P30291 646 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF460Q14592 562 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT11Q495W5 492 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BOLA3Q53S33 107 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MZT2AQ6P582 158 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT7Q86SF2 657 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL6Q8N531 539 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DNERQ8NFT8 737 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TMBIM1Q969X1 311 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS12Q96DT0 336 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS39Q96JC1 886 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BDH2Q9BUT1 245 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 OPTCQ9UBM4 332 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 USP22Q9UPT9 525 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SERTM1A2A2V5 107 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 STMND1H3BQB6 276 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKD3O94806 890 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPLP05186 524 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 BMP1P13497 986 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD17B1P14061 328 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJB1P25685 340 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 UQCRC1P31930 480 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf58P58505 322 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 GABARAPL2P60520 117 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 MYL6P60660 151 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF404Q494X3 552 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 TRNP1Q6NT89 227 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-203ENST00000439720 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms