RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TYRP1P17643 537 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CA5AP35218 305 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARSDP51689 593 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTSCP53634 463 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OLIG2Q13516 323 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLCA4Q14CN2 919 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARP6Q2NL67 630 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANKS6Q68DC2 871 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 VASH2Q86V25 355 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM71DQ8N9W8 422 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PMEPA1Q969W9 287 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SGF29Q96ES7 293 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C9orf72Q96LT7 481 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZPBPQ9BS86 351 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ASB8Q9H765 288 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FBXO8Q9NRD0 319 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OGFRQ9NZT2 677 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCTD3Q9Y597 815 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHL33A6NCF5 533 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C1QL1O75973 258 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C9P02748 559 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANKRD34CP0C6C1 535 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HADHAP40939 763 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR18Q14330 331 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SPARCL1Q14515 664 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FNBP1LQ5T0N5 605 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DET1Q7L5Y6 550 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NKD1Q969G9 470 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HES6Q96HZ4 224 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TGM7Q96PF1 710 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSGA10Q9BZW7 698 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WDR37Q9Y2I8 494 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCN8AQ9UQD0 1980 aa13.11□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMD3O43242 534 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RALBP11234 206 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GFERP55789 205 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMPRSS15P98073 1019 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 XIAPP98170 497 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LY6DQ14210 128 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NFE2L1Q14494 772 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPE65Q16518 533 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 P3H1Q32P28 736 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 METRNLQ641Q3 311 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCTD11Q693B1 232 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF843Q8N446 348 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ULK4Q96C45 1275 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RTP4Q96DX8 246 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DCUN1D1Q96GG9 259 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZDHHC12Q96GR4 267 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTRCQ99895 268 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC40Q9H9A6 602 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CRLS1Q9UJA2 301 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.1□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MGAT4DA6NG13 374 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGAP14A8MT82 685 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LDB2O43679 373 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KRT86O43790 486 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAD1O60671 282 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RASSF9O75901 435 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 METTL18O95568 372 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGB2P05107 769 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGALP20701 1170 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CAPZBP47756 277 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GSDMDP57764 484 aa13.09□□□□□ -0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BCL7AQ4VC05 210 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms