RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415188.1

USP4-203, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP4, Length 1,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-203ENST00000415188 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.65□□□□□ -0.06
USP4-203ENST00000415188 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.65□□□□□ -0.06
USP4-203ENST00000415188 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.65□□□□□ -0.06
USP4-203ENST00000415188 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ACOT8O14734 319 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 LILRB5O75023 590 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 VPS26AO75436 327 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 GJB3O75712 270 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CDK14O94921 469 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 CAPNS1P04632 268 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 MTHFD2P13995 350 aa14.64□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 ERFP50548 548 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 SCNN1BP51168 640 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CCR3P51677 355 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 MED21Q13503 144 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 LRRC32Q14392 662 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 SPATS1Q496A3 300 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 SFT2D3Q587I9 215 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 STK40Q8N2I9 435 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 HIPK4Q8NE63 616 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 NPAS2Q99743 824 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 IER2Q9BTL4 223 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 RNF112Q9ULX5 631 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 OBSL1O75147 1896 aa14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 C2orf78A6NCI8 922 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 UBXN8O00124 270 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 MRASO14807 208 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 TRIM24O15164 1050 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 KLK8O60259 260 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 NRP2O60462 931 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 GFAPP14136 432 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 DPP6P42658 865 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 RGRP47804 291 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CXCL12P48061 93 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 PTPRCAPQ14761 206 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 COQ5Q5HYK3 327 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 LPCAT4Q643R3 524 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ANKS6Q68DC2 871 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 TTC16Q8NEE8 873 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 TSPEARQ8WU66 669 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CHFRQ96EP1 664 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.63□□□□□ -0.07
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USP4-203ENST00000415188 MLYCDO95822 493 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 KLKB1P03952 638 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 PIRTP0C851 137 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 CD1EP15812 388 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 FMO4P31512 558 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 ID4P47928 161 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 AQP4P55087 323 aa14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP4-203ENST00000415188 GRIK2Q13002 908 aa14.63□□□□□ -0.07
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