RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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UBE2E3-202ENST00000410062 MARCH9Q86YJ5 346 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC1Q99614 292 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KLK13Q9UKR3 277 aa23.43■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM149AA5PLN7 773 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 MGAT4DA6NG13 374 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 RHPN2P1A8MT19 583 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PPM1DO15297 605 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNJ13O60928 360 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BBS9Q3SYG4 887 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PACS1Q6VY07 963 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OR2L2Q8NH16 312 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.42■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SMAPO00193 183 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BRAFP15056 766 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PAMP19021 973 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.41■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 USP1O94782 785 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 AP2A2O94973 939 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC2A4P14672 509 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CCL7P80098 99 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 METRNLQ641Q3 311 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 DUPD1Q68J44 220 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 XKR5Q6UX68 686 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP206Q8IYR0 622 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PDIK1LQ8N165 341 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A0G2JNG1 304 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KIR2DS3K7RE56 304 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PNLIPP16233 465 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 FASLGP48023 281 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TTPAP49638 278 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 HHEXQ03014 270 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBB2AQ13885 445 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 KIR2DS5Q14953 304 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCA4Q14CN2 919 aa23.4■■□□□ 1.34
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UBE2E3-202ENST00000410062 AGAP9Q5VTM2 703 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 WASH2PQ6VEQ5 465 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF438Q7Z4V0 828 aa23.4■■□□□ 1.34
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UBE2E3-202ENST00000410062 TMPRSS12Q86WS5 348 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CCNJLQ8IV13 435 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 IGDCC3Q8IVU1 814 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 GALNT15Q8N3T1 639 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 BBOF1Q8ND07 529 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 CPNE7Q9UBL6 633 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa23.4■■□□□ 1.34
UBE2E3-202ENST00000410062 OR5K4A6NMS3 321 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52A4PA6NMU1 304 aa23.39■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 POLBP06746 335 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 JUPP14923 745 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 PGAM1P18669 254 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ALDH4A1P30038 563 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL4CP56559 192 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1D5P58170 312 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 MRNIPQ6NTE8 343 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC9B2Q86UD5 537 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 VPS37BQ9H9H4 285 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 WHRNQ9P202 907 aa23.39■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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UBE2E3-202ENST00000410062 A0A1W2PQM1 296 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 KLHL33A6NCF5 533 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 MT-CO3P00414 261 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC19A1P41440 591 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SHC2P98077 582 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXK2Q01167 660 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC7A5Q01650 507 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CALCOCO2Q13137 446 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 NEPROQ6NW34 567 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 C8orf74Q6P047 294 aa23.38■■□□□ 1.33
UBE2E3-202ENST00000410062 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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