RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FADS3Q9Y5Q0 445 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3PXD2BA1X283 911 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 EI24O14681 340 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NIPSNAP2O75323 286 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 UMPSP11172 480 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NFYCQ13952 458 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RCAN2Q14206 197 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO39Q8N4B4 442 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DHRSXQ8N5I4 330 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TERB1Q8NA31 727 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXL20Q96IG2 436 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD12Q6UB98 2062 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPAN12O95859 305 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ENTPD1P49961 510 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DIO3P55073 304 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK10P57789 538 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D21Q8IYX1 336 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LHX3Q9UBR4 397 aa23.6■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CROCCQ5TZA2 2017 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PRR35P0CG20 571 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DCKP27707 260 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF12Q16514 161 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC22A12Q96S37 553 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ANAPC2Q9UJX6 822 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 COL4A6Q14031 1691 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR39O43194 453 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CYBBP04839 570 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS9P46781 194 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LIPEQ05469 1076 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CYBRD1Q53TN4 286 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RABL3Q5HYI8 236 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CARNMT1Q8N4J0 409 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TBCCD1Q9NVR7 557 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 AIG1Q9NVV5 245 aa23.59■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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AMIGO1-201ENST00000369862 EEDO75530 441 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CRCPO75575 148 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CLIC3O95833 236 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RPS17P08708 135 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 AGTR2P50052 363 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PMS2P3Q13401 168 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 IFNEQ86WN2 208 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.58■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ASPDHA6ND91 283 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 BTN3A1O00481 513 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF12O95522 483 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 APLP1P51693 650 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ECT2LQ008S8 904 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS33AQ96AX1 596 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF639Q9UID6 485 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 H0Y626 953 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BMQ9 156 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 GIPC1O14908 333 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ATE1O95260 518 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SOD2P04179 222 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 TTPAP49638 278 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ZXDBP98169 803 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB39AQ14964 217 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKS6Q68DC2 871 aa23.57■■□□□ 1.36
AMIGO1-201ENST00000369862 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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