RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF542PQ5EBM4 170 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM61Q5EBN2 209 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 GRTP1Q5TC63 336 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM220Q6QAJ8 160 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 BIRC8Q96P09 236 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 RMI1Q9H9A7 625 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 SNX11Q9Y5W9 270 aa29.14■■■□□ 2.26
ECHS1-201ENST00000368547 CACNA1EQ15878 2313 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.251e-7■■■■■ 36.3
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ECHS1-201ENST00000368547 TUBB8Q3ZCM7 444 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SLC23A3Q6PIS1 610 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CRTC3Q6UUV7 619 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 HID1Q8IV36 788 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF547Q8IVP9 402 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SMOC1Q9H4F8 434 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CAPN10Q9HC96 672 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 FSCN3Q9NQT6 498 aa29.13■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GRID2O43424 1007 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 AP2A2O94973 939 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RETP07949 1114 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CTSKP43235 329 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GNPDA1P46926 289 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GYS2P54840 703 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PPARDQ03181 441 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CTSL3PQ5NE16 218 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 MCMBPQ9BTE3 642 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CAAP1Q9H8G2 361 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC28Q9NX36 388 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 KLF15Q9UIH9 416 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GNPTGQ9UJJ9 305 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A14Q9UN76 642 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GPR34Q9UPC5 381 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SCAMP1O15126 338 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ESR1P03372 595 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SLC18A1P54219 525 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF549Q6P9A3 640 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TIFABQ6ZNK6 161 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 LRRTM4Q86VH4 590 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT13Q8IUC8 556 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 SMC6Q96SB8 1091 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 DGKBQ9Y6T7 804 aa29.12■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 KNL1Q8NG31 2342 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 OR56A5P0C7T3 313 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PKMP14618 531 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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ECHS1-201ENST00000368547 PRLHRP49683 370 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 HK3P52790 923 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GRIK2Q13002 908 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 BCL7AQ4VC05 210 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PYCR3Q53H96 274 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G2CQ5R387 149 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RBBP8Q99708 897 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC68Q9H2F9 335 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RHOJQ9H4E5 214 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GMEB2Q9UKD1 530 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 GPSM3Q9Y4H4 160 aa29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 RASGRP1O95267 797 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TNFP01375 233 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 MT-ND3P03897 115 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 NDNQ99608 321 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TM7SF3Q9NS93 570 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PCDH15Q96QU1 1955 aa29.1■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 IQCF5A8MTL0 148 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM49D1C9J1S8 452 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 QSOX1O00391 747 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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ECHS1-201ENST00000368547 SPRP35270 261 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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ECHS1-201ENST00000368547 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 PHACTR4Q8IZ21 702 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 VPS39Q96JC1 886 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 OR2M4Q96R27 311 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PPM1 405 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 HMX2A2RU54 273 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 KMOO15229 486 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 NME1P15531 152 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 JUNDP17535 347 aa29.09■■■□□ 2.25
ECHS1-201ENST00000368547 ATP1A2P50993 1020 aa29.09■■■□□ 2.25
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