RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CCNIQ14094 377 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM110Q86TL2 294 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KRT33AO76009 404 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 METTL18O95568 372 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GAD2Q05329 585 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ACDQ96AP0 544 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-21P61565 698 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP1Q07960 439 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LIN54Q6MZP7 749 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 DMTF1Q9Y222 760 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN2DO15399 1336 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 AGPSO00116 658 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 AHCYL1O43865 530 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CMPK1P30085 196 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 DGKGP49619 791 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KIFC1Q9BW19 673 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 AZIN2Q96A70 460 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MTRRQ9UBK8 725 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CD84Q9UIB8 345 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ASB3Q9Y575 518 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GNAZP19086 355 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC182A6NF36 153 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TPGS2Q68CL5 300 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF563Q8TA94 476 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HBEGFQ99075 208 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 EXO5Q9H790 373 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TULP3O75386 442 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FABP3P05413 133 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ACTR3P61158 418 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM32Q13049 653 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 QPRTQ15274 297 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PYDC2Q56P42 97 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 REP15Q6BDI9 236 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf109Q9NX04 203 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PIP5K1BO14986 540 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 INHAP05111 366 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 THRBP10828 461 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MYBPC1Q00872 1141 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GJD3Q8N144 294 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO2A1Q92959 643 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TCF25Q9BQ70 676 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ABCG4Q9H172 646 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RAB26Q9ULW5 256 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 M0R2N6 131 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF11BO00300 401 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PRKCZQ05513 592 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 BEND5Q7L4P6 421 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM192Q8IY95 271 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT8Q9NY28 637 aa20.04■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN4O14493 209 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC1A2P43004 574 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IDH3AP50213 366 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ACLYP53396 1101 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF599Q96NL3 588 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RASSF1Q9NS23 344 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC72A6NJI9 287 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PLK4O00444 970 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 BCKDKO14874 412 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms