RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A3Q99624 504 aa26.49■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 DKK4Q9UBT3 224 aa26.49■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 SAR1BQ9Y6B6 198 aa26.49■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS21Q9Y6M0 314 aa26.49■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 CTAGE9A4FU28 777 aa26.48■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 SLC2A4P14672 509 aa26.48■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 AFTPHQ6ULP2 937 aa26.48■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 OR5K4A6NMS3 321 aa26.47■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP99D6REC4 459 aa26.47■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 CPNE6O95741 557 aa26.47■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 GPR150Q8NGU9 434 aa26.47■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 OR2L2Q8NH16 312 aa26.47■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 RALBP11234 206 aa26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 MPSTP25325 297 aa26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 CCKBRP32239 447 aa26.46■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 LAMB3Q13751 1172 aa26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.46■■□□□ 1.83
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TPGS1-201ENST00000359315 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
TPGS1-201ENST00000359315 OR1I1O60431 355 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ13O60928 360 aa26.45■■□□□ 1.82
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TPGS1-201ENST00000359315 ARNTP27540 789 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 MAPK9P45984 424 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 LSSP48449 732 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEP78395 509 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 METRNLQ641Q3 311 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP9Q7RTR0 991 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 PIM3Q86V86 326 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 GRK7Q8WTQ7 553 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 HEXDCQ8WVB3 486 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD3Q96ES6 412 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM74Q96NL1 305 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 WWP1Q9H0M0 922 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 FREM2Q5SZK8 3169 aa26.45■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC187A0A096LP49 1063 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa26.44■■□□□ 1.82
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TPGS1-201ENST00000359315 POLBP06746 335 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf72Q14CZ0 275 aa26.44■■□□□ 1.82
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TPGS1-201ENST00000359315 PHF19Q5T6S3 580 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM48Q8IWZ4 208 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 NAT8LQ8N9F0 302 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 RCBTB1Q8NDN9 531 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 OR4L1Q8NH43 312 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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TPGS1-201ENST00000359315 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC74BQ96LY2 380 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 RMDN2Q96LZ7 410 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINB12Q96P63 405 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 KIFC1Q9BW19 673 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 POT1Q9NUX5 634 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 OGFRQ9NZT2 677 aa26.44■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 LILRA5A6NI73 299 aa26.43■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 GPLD1P80108 840 aa26.43■■□□□ 1.82
TPGS1-201ENST00000359315 PTK6Q13882 451 aa26.43■■□□□ 1.82
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