RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333467.3

APOBEC3B-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-201ENST00000333467 CLEC14AQ86T13 490 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 LZTR1Q8N653 840 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM136AQ96C01 138 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 MYOCQ99972 504 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SNX15Q9NRS6 342 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 NDE1Q9NXR1 346 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 HACD3Q9P035 362 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ARMCX1Q9P291 453 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 VTI1BQ9UEU0 232 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SCOCQ9UIL1 159 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 KLK13Q9UKR3 277 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 DMTF1Q9Y222 760 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZZEF1O43149 2961 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 MYLKQ15746 1914 aa11□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 A0A1B0GTQ1 180 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 A0A1W2PQU0 124 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PCDHGA12O60330 932 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRIM13O60858 407 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMCC1O94876 653 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 C1QTNF9P0C862 333 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ADRB3P13945 408 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ANPEPP15144 967 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ERCC2P18074 760 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 GKP32189 559 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CPOXP36551 454 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 NUDT1P36639 197 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SERPINB5P36952 375 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ABL2P42684 1182 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 GRK6P43250 576 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 NXPH1P58417 271 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CDH17Q12864 832 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 RCN2Q14257 317 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ST3GAL2Q16842 350 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 C1orf146Q5VVC0 180 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 DBX2Q6ZNG2 339 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 GLRX5Q86SX6 157 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 WDR60Q8WVS4 1066 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 KLK6Q92876 244 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 HMCESQ96FZ2 354 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 THTPAQ9BU02 230 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 HDAC8Q9BY41 377 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CDH19Q9H159 772 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 FZD3Q9NPG1 666 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PDP2Q9P2J9 529 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CA5BQ9Y2D0 317 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 IGF2RP11717 2491 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 KDELR3O43731 214 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 TRIM16O95361 564 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 KITP10721 976 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CRABP2P29373 138 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 IDH3AP50213 366 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 MPP3Q13368 585 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SHBQ15464 509 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 INAVAQ3KP66 663 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PARP15Q460N3 678 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CFAP157Q5JU67 520 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CES4AQ5XG92 561 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 HORMAD1Q86X24 394 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 GATAD2AQ86YP4 633 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM126BQ8IUX1 230 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PNPLA1Q8N8W4 532 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 DNAAF3Q8N9W5 541 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 MFSD2AQ8NA29 543 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms